Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo4Q149C3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Lingo4Q149C3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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