Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Perm1Q149B8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Perm1Q149B8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms