Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc162pQ0VG85 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms