Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Ttc39dQ0VF76 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Ttc39dQ0VF76 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Ttc39dQ0VF76 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Ttc39dQ0VF76 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Ttc39dQ0VF76 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Ttc39dQ0VF76 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc39dQ0VF76 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms