Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd12Q0VE29 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms