Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc1Q0VDN7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms