Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neurl1bQ0MW30 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms