Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf541Q0GGX2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms