Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms