Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnma1Q08460 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms