Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb2Q08331 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms