Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CbfbQ08024 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CbfbQ08024 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CbfbQ08024 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CbfbQ08024 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CbfbQ08024 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CbfbQ08024 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CbfbQ08024 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CbfbQ08024 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CbfbQ08024 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CbfbQ08024 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CbfbQ08024 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CbfbQ08024 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CbfbQ08024 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms