Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms