Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms