Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nfe2Q07279 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2Q07279 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms