Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms