Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp2Q06649 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms