Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf4Q06507 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms