Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Prrx2Q06348 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms