Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cab39Q06138 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms