Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms