Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a1Q05722 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms