Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms