Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox9Q04887 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms