Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha4Q03137 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms