Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1sQ02789 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms