Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnb1Q02248 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnb1Q02248 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnb1Q02248 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms