Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms