Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms