Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga4Q00651 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms