Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms