Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pax8Q00288 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms