Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms