Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms