Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn1bP97952 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms