Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrn1P97789 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrn1P97789 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrn1P97789 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrn1P97789 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrn1P97789 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrn1P97789 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms