Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms