Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smarcc1P97496 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smarcc1P97496 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms