Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab3P97382 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms