Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms