Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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