Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Arf1P84078 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Arf1P84078 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Arf1P84078 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms