Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms