Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx1P81068 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms