Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms