Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UrodP70697 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UrodP70697 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UrodP70697 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UrodP70697 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UrodP70697 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UrodP70697 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UrodP70697 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms