Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms