Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shox2P70390 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms