Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tbx6P70327 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbx6P70327 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms