Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sycp3P70281 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp3P70281 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms